Нарушения функции шишковидной железы (эпифиза) встречаются редко, преимущественно в детском возрасте. Опухоли, разрушающие эпифиз, наблюдаются у детей до 12 лет. Они сопровождаются преждевременной половой зрелостью и ускоренным психическим развитием. Быстрое развитие первичных и вторичных половых признаков является одним из ранних симптомов так называемого эпифизарного синдрома.
Относительно патогенеза данного заболевания многое остается невыясненным ввиду того, что физиологическое значение этой железы мало исследовано. Опыты по удалению шишковидной железы очень немногочисленны, так как доступ к ней крайне затруднен. Экстирпация этой железы у молодых петухов вызывает признаки раннего полового созревания. Введение экстрактов эпифиза угнетает выделение гипофизом гонадотропных гормонов. При этом андрогены с мочой выделяются в меньшем количестве.