Дефекация в основном является актом рефлекторным. Центры, регулирующие акт дефекации, находятся в поясничной (расслабление сфинктеров) и крестцовой (сокращение сфинктеров) частях спинного мозга. Деятельность их регулируется расположенными выше отделами центральной нервной системы, в частности промежуточным мозгом и мозговой корой (центральная передняя извилина).
Расстройства дефекации возникают от поражения центров, регулирующих этот процесс. Задержка дефекации может быть результатом сокращения сфинктеров, m. levatoris ani и ряда произвольных мышц промежности вследствие возбуждения соответствующих центров. Недержание кала наблюдается от паралича сфинктеров, возникшего из-за нарушения деятельности центров, например в глубокой старости, при опухолях, эпилепсии, от страха.
Механизм расстройства дефекации иногда заключается в ослаблении чувствительных восприятий в прямой кишке при раздражении каловыми массами, вследствие чего тормозится рефлекс на дефекацию. В других случаях, наоборот, повышается чувствительность слизистой оболочки и усиливается позыв на низ, например при воспалении слизистой в области сфинктеров.
Наконец, дефекация может быть затруднена вследствие понижения перистальтики кишок или вялости брюшного пресса, например у стариков или у женщин вскоре после родов.