Большим достижением советского периода развития анатомии является организация анатомических музеев. Теперь на кафедрах анатомии, как правило, создаются фундаментальные и учебные музеи. Особенно богатые коллекции анатомических препаратов собраны в музеях кафедр анатомии Военно-медицинской академии, I Московского, II Московского, Ленинградских, Одесского, Казахского и других медицинских институтов.
В 1931 г. при кафедре анатомии Харьковского медицинского института был открыт "Музей становления человека". И по замыслу, и по воплощению это был оригинальный анатомический музей, в котором находились уникальные научно-познавательные коллекции, систематизированные учебные пособия, лекционные препараты. Музей мог служить для учебных целей и ведения научно-пропагандистской работы.
Еще В. Н. Тонков к решению вопроса о назначении и принципах организации музеев подходил строго научно. Свои взгляды на этот счет он впервые изложил в 1903 г. В 1904 г. в специальной статье он подводит итоги своей работы по созданию учебного музея при кафедре нормальной анатомии Женского медицинского института в Петербурге. В 1906 г. В. Н. Тонков печатает сообщение об анатомических музеях в немецком журнале, а в 1912 г. публикует большую статью об учебном музее при кафедре нормальной анатомии Казанского университета. Не случайно В. П. Воробьев, глубоко понимавший смысл музейного дела, сам создавший великолепный анатомический музей в Харьковском медицинском институте, отзывался о Тонкове, как об одном из первых организаторов учебных музеев.
Организация анатомического музея при Естественнонаучном институте имени П. Ф. Лесгафта была начата в 1893 г. В 1923 г. этот музей располагал 25 000 препаратов и по ценности коллекции превосходил другие музеи подобного рода.
После Великой Октябрьской социалистической революции В. Н. Тонков неутомимо боролся за дальнейшее развитие анатомических музеев. Он находил горячую поддержку со стороны всех советских анатомов. Музейное дело стало государственной проблемой, предметом внимания Коммунистической партии и Советского правительства. Широкий размах музейного строительства для пропаганды и популяризации достижений науки и техники выдвинул нашу страну по количеству и богатству музеев на первое место в мире.
С начала XX века музейное дело привлекало пристальное внимание передовых анатомов. В. Н. Тонков работал над созданием учебного музея при кафедре анатомии. Ф. А. Стефанис делился опытом создания учебного музея при кафедре описательной анатомии Киевского университета. Все более расширялись фонды анатомического музея Московского университета, коллекции которого благодаря трудам И. М. Соколова и Д. Н. Зернова включают тысячи препаратов. Был создан анатомический музей в Томске (Г. М. Иосифов).
В советское время в печати обсуждалась идея создания центрального музея человека. В нем можно было бы раскрыть строение организма человека, историю его происхождения, становления и индивидуального развития.