Для понимания строения человека большое значение имеет сравнительная анатомия.
Основы ее возникли значительно позднее, чем данные по анатомии животных и человека, тем не менее некоторые отрывочные сведения мы встречаем у Аристотеля, Галена и Везалия. Развитие сравнительно-анатомического метода и формирование сравнительной анатомии как науки обычно исчисляют с XVII века и связывают с трудами Северино (1580-1656), Виллиса (1621 -1675), которые сопоставили строение человека и животных. Это была первая попытка создания опорных пунктов для гипотезы о происхождении человека и начала эволюционного учения. В XVIII веке в Голландии Кампер (1722-1789), в Англии Хантер (1728-1793), во Франции Вик д'Азир (1748-1794) показали сходство строения и функции основных органов, систем человека и животных, приспособляемость и зависимость систем от характера питания. Большого расцвета достигла сравнительная анатомия в XVIII и XIX веках после опубликования трудов Кювье и Сент-Илера.
Жорж Кювье (1769-1832) внес вклад не только в сравнительную анатомию, но и в систематику животных, являясь создателем палеонтологии. Кювье по отдельным костям мог производить реконструкцию всего скелета. Он предложил сгруппировать всех животных в четыре типа, учитывая особенности строения скелета, нервной системы и кровообращения. Большой фактический материал по сравнительной анатомии и палеонтологии, накопленный Кювье, был хорошей базой для обоснования учения об эволюционном развитии.
Сент-Илер (1772-1844) обобщил свои исследования по сравнительной анатомии в книге "Философия анатомии" (1822). Его концепция сводилась к тому, что все животные построены по единому принципу, гомологичные части тела сохраняются у всех видов животных. Например, рука человека соответствует передней конечности животных. По его принципу коннексий, т. е. взаимосвязи, гомологичные части тела всегда располагаются одинаково относительно смежных частей. Этот принцип независимо от Сент-Илера обосновал Гете (1749-1832). Сент-Илер создал науку об уродствах - тератологию. В целом его учение по сравнительной анатомии показывало, что животные происходят от других вымерших животных и в органическом мире возможны трансформации. Эти идеи развития животного мира для того времени были весьма прогрессивными.
Значительный вклад в сравнительную анатомию внесли немецкий ученый и поэт Гете и русский ученый-натуралист К. М. Бэр, подошедшие вплотную к теории эволюционного развития животного мира, но не сумевшие открыть ее законы.